Two high-risk susceptibility loci at 6p25.3 and 14q32.13 for Waldenström macroglobulinemia - Université Paris Cité Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nature Communications Année : 2018

Two high-risk susceptibility loci at 6p25.3 and 14q32.13 for Waldenström macroglobulinemia

Mary Mcmaster (1) , Sonja I Berndt (1) , Jianqing Zhang , Susan L. Slager , Shengchao Alfred Li , Claire Vajdic , Karin E. Smedby , Huihuang Yan , Brenda Birmann , Elizabeth Brown , Alex Smith , Geffen Kleinstern , Mervin Fansler , Christine Mayr , Bin Zhu , Charles Chung , Ju-Hyun Park , Laurie Burdette , Belynda Hicks , Amy Hutchinson , Lauren Teras , Hans-Olov Adami , Paige Bracci , James Mckay (2) , Alain Monnereau (3, 4) , Brian K. Link (5) , Roel Vermeulen , Stephen Ansell (6) , Ann Maria , W. Ryan Diver , Mads Melbye , Akinyemi Ojesina , Peter Kraft , Paolo Boffetta (7, 8) , Jacqueline Clavel (9) , Edward Giovannucci , Caroline Besson (10) , Federico Canzian , Ruth Travis , Paolo Vineis , Elisabete Weiderpass , Rebecca Montalvan , Zhaoming Wang , Meredith Yeager , Nikolaus Becker (11) , Yolanda Benavente (12) , Paul Brennan (13) , Lenka Foretova (14) , Marc Maynadié (15, 16, 17) , Alexandra Nieters , Silvia de Sanjosé , Anthony Staines , Lucia Conde , Jacques Riby , Bengt Glimelius , Henrik Hjalgrim , Nisha Pradhan , Andrew Feldman , Anne J. Novak , Charles Lawrence , Bryan Bassig , Qing Lan , Tongzhang Zheng , Kari E. North (18) , Lesley F. Tinker (19) , Wendy Cozen (20) , Richard K. Severson (21) , Jonathan N. Hofmann (1) , Yawei Zhang (22) , Rebecca D. Jackson (23) , Lindsay M. Morton (1) , Mark P. Purdue (1) , Nilanjan Chatterjee (1, 24) , Kenneth Offit (25) , James R. Cerhan (6) , Stephen J. Chanock (1) , Nathaniel Rothman (1) , Joseph Vijai (25) , Lynn R. Goldin (1) , Christine Skibola (26) , Neil E. Caporaso (1)
1 NCI-NIH - National Cancer Institute [Bethesda]
2 IACR - International Agency for Cancer Research
3 CRESS - U1153 - Equipe 7 : EPICEA - Epidémiologie des cancers de l'enfant et de l'adolescent
4 BPH - Bordeaux population health
5 Department of Internal Medicine [Iowa City]
6 Mayo Clinic [Rochester]
7 MSSM - Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York]
8 The Tisch Cancer Institute
9 CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153) - Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité
10 CESP - Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations
11 Division of Molecular Genetic Epidemiology, German Cancer Research Center (DKFZ), Heidelberg, Germany
12 IDIBELL - Institut d'Investigació Biomèdica de Bellvitge = Bellvitge Biomedical Research Institute
13 CIRC - IARC - Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer
14 MMCI - Masaryk Memorial Cancer Institute
15 RHEMCO - Registre des hématopathies malignes de Côte d'Or
16 UB - Université de Bourgogne
17 CHU Dijon - Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand
18 Carolina Center for Genome Sciences
19 FHCRC - Fred Hutchinson Cancer Research Center [Seattle]
20 Keck School of Medicine [Los Angeles]
21 Wayne State University [Detroit]
22 YSPH - Yale School of Public Health
23 OSU - Ohio State University [Columbus]
24 Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health [Baltimore]
25 Memorial Sloane Kettering Cancer Center [New York]
26 Emory University [Atlanta, GA]
Jianqing Zhang
  • Fonction : Auteur
Susan L. Slager
  • Fonction : Auteur
Shengchao Alfred Li
  • Fonction : Auteur
Claire Vajdic
  • Fonction : Auteur
Karin E. Smedby
  • Fonction : Auteur
Huihuang Yan
  • Fonction : Auteur
Brenda Birmann
  • Fonction : Auteur
Elizabeth Brown
  • Fonction : Auteur
Alex Smith
  • Fonction : Auteur
Geffen Kleinstern
  • Fonction : Auteur
Mervin Fansler
  • Fonction : Auteur
Christine Mayr
  • Fonction : Auteur
Bin Zhu
  • Fonction : Auteur
Charles Chung
  • Fonction : Auteur
Ju-Hyun Park
  • Fonction : Auteur
Laurie Burdette
  • Fonction : Auteur
Belynda Hicks
  • Fonction : Auteur
Amy Hutchinson
  • Fonction : Auteur
Lauren Teras
  • Fonction : Auteur
Hans-Olov Adami
  • Fonction : Auteur
Paige Bracci
  • Fonction : Auteur
Roel Vermeulen
  • Fonction : Auteur
Stephen Ansell
Ann Maria
  • Fonction : Auteur
W. Ryan Diver
  • Fonction : Auteur
Mads Melbye
  • Fonction : Auteur
Akinyemi Ojesina
  • Fonction : Auteur
Peter Kraft
Edward Giovannucci
  • Fonction : Auteur
Federico Canzian
Ruth Travis
  • Fonction : Auteur
Paolo Vineis
  • Fonction : Auteur
Elisabete Weiderpass
  • Fonction : Auteur
Rebecca Montalvan
  • Fonction : Auteur
Zhaoming Wang
  • Fonction : Auteur
Meredith Yeager
  • Fonction : Auteur
Alexandra Nieters
  • Fonction : Auteur
Silvia de Sanjosé
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 910631
Anthony Staines
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1042813
Lucia Conde
  • Fonction : Auteur
Jacques Riby
  • Fonction : Auteur
Bengt Glimelius
  • Fonction : Auteur
Henrik Hjalgrim
  • Fonction : Auteur
Nisha Pradhan
  • Fonction : Auteur
Andrew Feldman
  • Fonction : Auteur
Anne J. Novak
  • Fonction : Auteur
Charles Lawrence
  • Fonction : Auteur
Bryan Bassig
  • Fonction : Auteur
Qing Lan
  • Fonction : Auteur
Tongzhang Zheng
  • Fonction : Auteur
Nathaniel Rothman
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 906255

Résumé

Waldenström macroglobulinemia (WM)/lymphoplasmacytic lymphoma (LPL) is a rare, chronic B-cell lymphoma with high heritability. We conduct a two-stage genome-wide association study of WM/LPL in 530 unrelated cases and 4362 controls of European ancestry and identify two high-risk loci associated with WM/LPL at 6p25.3 (rs116446171, near EXOC2 and IRF4; OR = 21.14, 95% CI: 14.40-31.03, P = 1.36 × 10-54) and 14q32.13 (rs117410836, near TCL1; OR = 4.90, 95% CI: 3.45-6.96, P = 8.75 × 10-19). Both risk alleles are observed at a low frequency among controls (~2-3%) and occur in excess in affected cases within families. In silico data suggest that rs116446171 may have functional importance, and in functional studies, we demonstrate increased reporter transcription and proliferation in cells transduced with the 6p25.3 risk allele. Although further studies are needed to fully elucidate underlying biological mechanisms, together these loci explain 4% of the familial risk and provide insights into genetic susceptibility to this malignancy.

Dates et versions

hal-02061532 , version 1 (08-03-2019)

Identifiants

Citer

Mary Mcmaster, Sonja I Berndt, Jianqing Zhang, Susan L. Slager, Shengchao Alfred Li, et al.. Two high-risk susceptibility loci at 6p25.3 and 14q32.13 for Waldenström macroglobulinemia. Nature Communications, 2018, 9 (1), pp.4182. ⟨10.1038/s41467-018-06541-2⟩. ⟨hal-02061532⟩
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